El templo y ex monasterio de San Francisco fue el primer edificio religioso que se construyó en Querétaro. Data de 1540 y funcionó como catedral entre 1865 y 1911. El Museo Regional que ahora alberga está dedicado a ilustrar la historia de Querétaro y de México. Cuenta con un patio principal, un auditorio y algunas salas de exhibiciones.
